Dekret erygowania Parafii p.w. św. Kazimierza Królewicza we Wrześni wszedł w życie z dniem 2 maja 1983r. Pierwszym proboszczem był ks. Andrzej Zientek. Początkowo kult Boży sprawowano w kaplicy, którą wybudowano w ciągu 50 dni, a którą uroczyście poświęcił ks. Bp Jan Czerniak – 10 września 1983 roku. W krótkim czasie, dzięki zaangażowaniu parafian powstał Dom Katechetyczny wraz z plebanią. W dniu 14 kwietnia 1988 roku Prymas Kard. Józef Glemp wmurował kamień węgielny pod kościół. Z dniem 1 września 1988 roku dekretem ks. Prymasa proboszczem zostaje ks. Stanisław Głowski. Konsekracja Kościoła miała miejsce w święto św. Stanisława Kostki – patrona młodzieży, czyli 18 września 1996r., a dokonał jej Abp Henryk Józef Muszyński.
Kościół to nowoczesna budowla z wieżą, na której zawieszono trzy dzwony, a w roku 2001 elektroniczny zegar z czterema tarczami. Wnętrze kościoła z czterema rzędami ławek.
W Kościele umieszczone są następujące witraże przedstawiające:
- św. Wojciecha, św. Jadwigę, św. Kazimierza, „Pogoń” – herb Litwy z Matką Bożą Ostrobramską oraz św. Stanisława
- trzy cnoty Boskie: Wiarę, Nadzieję i Miłość
- trzy Osoby Boskie: Boga Ojca, Syna Bożego i Ducha Św.
W zakrystii księży umieszczono witraże obrazujące:
- herb Ojca św. na tle Bazyliki Watykańskiej oraz herb ks. Abp. Henryka Muszyńskiego na tle Bazyliki Gnieźnieńskiej
W zakrystii ministranckiej znajdują się witraże:
- św. Dominika Savio i św. Jana Bosko.
Nad wejściem głównym jest witraż okrągły (2,5m średnicy) z Matką Bożą i Dzieciątkiem Jezus.
Od strony wieży witraże - symbole apostolskie: św. Mateusza, św. Łukasza, św. Marka, św. Jana.
Z okazji 20-lecia parafii w 2003 roku powstało malowidło na jednej ze ścian przy ołtarzu, ilustrujące życie Świętego Kazimierza - patrona parafii oraz znajdujący się w jego centrum obraz Matki Boskiej Częstochowskiej, a także wykonano ozdobę, okalającą tabernakulum w postaci krzewu gorejącego.
Kolejnymi proboszczami byli: ks. Andrzej Szczęsny od 2007-2008, ks. Tomasz Głuszak od 2008 do 2009 roku. Aktualnie proboszczem parafii od 2009 roku jest ks. Dariusz Kozłowski.
